教育部為更進一步落實大學自主精神，引導大學多元發展，於101年7月公布「教育部試辦認定大學校院自我評鑑結果審查作業原則」（此作業原則於105年10月6日更名為「教育部認定大學校院自我評鑑機制及結果審查作業原則」），詳盡規範大學自我評鑑機制與結果之認定標準，以協助大學建立一完善周延的自我評鑑機制，並據以實施自我評鑑（又稱「自辦外部評鑑」）；若學校建立之機制與執行之結果均獲教育部認定通過，學校可免予接受教育部同類型評鑑一次。
本校符合前述審查作業原則之申請資格，為全國34所優先試辦大學之一，已於101年8月起積極籌劃建立符合教育部規範之自我評鑑，除設置自我評鑑指導委員會、系所自我評鑑執行小組、自我評鑑工作小組等推動組織，另辦理數場說明會、評鑑專題演講、指導委員會議、執行小組會議及院∕系級會議，分層規劃、制訂與執行自我評鑑。本校制訂「自我評鑑實施辦法」、「自我評鑑申復辦法」及「104年度系所暨通識教育自我評鑑實施計畫」，於102年4月函送教育部申請認定。本校自我評鑑機制經審查，業於102年12月11日獲教育部認定「通過」。
本校自103年1月起展開各項評鑑工作，依據實施計畫於辦理「前置作業」、「自我評量」、「內部評鑑」、「自辦外部評鑑」及「申復」等作業，並於完成申復程序後，召開自我評鑑指導委員會議進行「評鑑結果評定」。本校於105年6月彙整全校評鑑歷程與結果資料函送高教評鑑中心（教育部委託單位）申請認定。本校自我評鑑結果經審查，業於105年10月24日獲教育部認定「通過」。教育部認定本次評鑑各受評單位之評鑑認可結果，認可有效期間為104-109年，並同意本校免予接受通識教育暨第二週期系所評鑑。
本校於105年11月公布本次評鑑各受評單位之評鑑認可結果。本次評鑑受評的32個單位中，除通識教育中心為「有條件通過」外，其他31個受評單位之各班制均獲「通過」認可。未來本校將持續敦促各受評單位落實執行自我改善，並定期追蹤。本校期望藉由自我評鑑之推動，能有效提升教育品質、增進辦學績效、發展學校特色及建立持續改善機制。
高雄醫學大學104年度系所暨通識教育自我評鑑各受評單位之評鑑結果 請點選查詢
相關資料：
＊教育部自我評鑑法規
大學法
大學評鑑辦法
教育部認定大學校院自我評鑑機制及結果審查作業原則
＊高教評鑑中心自我評鑑法規
＊本校自我評鑑法規
高雄醫學大學自我評鑑實施辦法
高雄醫學大學自我評鑑申復辦法
高雄醫學大學104年度系所暨通識教育自我評鑑實施計畫
＊本校自我評鑑相關會議紀錄、文件表單、參考資料